Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabpb2P81069 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabpb2P81069 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabpb2P81069 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabpb2P81069 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gabpb2P81069 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gabpb2P81069 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gabpb2P81069 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gabpb2P81069 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gabpb2P81069 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gabpb2P81069 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gabpb2P81069 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gabpb2P81069 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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