Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx3P81067 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms