Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms