Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tra2bP62996 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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