Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vbp1P61759 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vbp1P61759 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vbp1P61759 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vbp1P61759 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vbp1P61759 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vbp1P61759 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms