Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rad23aP54726 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms