Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CitP49025 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CitP49025 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CitP49025 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CitP49025 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CitP49025 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CitP49025 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CitP49025 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CitP49025 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms