Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tnfsf9P41274 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Tnfsf9P41274 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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