Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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LtbP41155 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtbP41155 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtbP41155 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtbP41155 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtbP41155 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtbP41155 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
LtbP41155 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LtbP41155 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms