Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nedd1P33215 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nedd1P33215 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms