Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc5P32043 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms