Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprmP28828 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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