Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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NdnP25233 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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NdnP25233 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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NdnP25233 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NdnP25233 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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