Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ggta1P23336 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms