Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PrkcaP20444 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms