Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18529 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P18529 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18529 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18529 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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