Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtpraP18052 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms