Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms