Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FosbP13346 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FosbP13346 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FosbP13346 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FosbP13346 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FosbP13346 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FosbP13346 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms