Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ifna9P09235 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ifna9P09235 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ifna9P09235 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ifna9P09235 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ifna9P09235 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ifna9P09235 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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