Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtaP09225 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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