Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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H2-Ab1P01921 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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H2-Ab1P01921 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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H2-Ab1P01921 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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