Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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