Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cops6O88545 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cops6O88545 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cops6O88545 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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