Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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