Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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BckdkO55028 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BckdkO55028 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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BckdkO55028 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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BckdkO55028 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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BckdkO55028 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
BckdkO55028 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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