Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Opn1mwO35599 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Opn1mwO35599 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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