Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Foxd2O35392 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Foxd2O35392 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Foxd2O35392 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Foxd2O35392 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Foxd2O35392 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Foxd2O35392 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Foxd2O35392 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Foxd2O35392 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Foxd2O35392 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms