Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccer2J3QPU5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccer2J3QPU5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms