Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3685J3QPP2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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