Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5849J3QPE5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms