Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms