Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20795J3QP49 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Gm20795J3QP49 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
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Gm20795J3QP49 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Gm20795J3QP49 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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