Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm20830J3KML6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm20830J3KML6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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