Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rfx2-202ENSMUST00000086801 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm37893-201ENSMUST00000192826 2437 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc30a2-202ENSMUST00000105872 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm38148-201ENSMUST00000195166 3012 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm42638-201ENSMUST00000196065 2587 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Prune2-207ENSMUST00000225351 2115 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Opn1sw-201ENSMUST00000080428 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpk-201ENSMUST00000043269 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hdac7-203ENSMUST00000116408 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Sh3bgrl2-204ENSMUST00000188241 3155 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lrit1-201ENSMUST00000120052 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 A730032A03Rik-202ENSMUST00000143202 1928 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms