Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10378F6XQQ1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10378F6XQQ1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10378F6XQQ1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10378F6XQQ1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10378F6XQQ1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10378F6XQQ1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10378F6XQQ1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Gm10378F6XQQ1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm10378F6XQQ1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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