Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Myo5cE9Q1F5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms