Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Phf11bB4XVQ1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Phf11bB4XVQ1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Phf11bB4XVQ1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Phf11bB4XVQ1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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