Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms