Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brpf1B2RRD7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms