Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp42B2RQC2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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