Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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