Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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