Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ubl3Q9Z2M6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubl3Q9Z2M6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms