Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RfxankQ9Z205 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms