Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cldn9Q9Z0S7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn9Q9Z0S7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms