Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Wdr54Q9R0D8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms