Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gpc6Q9R087 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms