Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Upk3aQ9JKX8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Upk3aQ9JKX8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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