Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms